Denigma - система распределенных исследований биологии старения

Открытая система распределенных исследований биологии старения: Денигма

Название Денигма – это аббревиатура от digital enigma (англ.) – цифровая загадка.

 

Проблема, на решение которой ориентирован проект

Процесс старения – это основная причина развития заболеваний, в результате которой ежедневно во всем мире умирает более 150 тысяч людей. Рак, диабет 2 типа, болезнь Альцгеймера, инсульт, заболевания сердечно-сосудистой системы по большей части вызваны старением. Поскольку старение является предпосылкой заболеваний, разумно исследовать его, понять его природу, и лечить как любое другое заболевание.

Разработка геропротекторных средств – один из величайших вызовов человечеству. Задача такого рода требует значительного объема научных знаний как в сфере биологии, так и в сфере информационных технологий. Благодаря существованию более трехсот теорий старения, исследования старения являются весьма разноплановыми, что часто не допускает возможности интеграции получаемого знания в единую систему. Исследователям старения недостает инструмента, который позволял бы провести точный анализ биологии человека на разных уровнях организации одновременно: пакеты данных не связаны между собой, методы их объединения сами по себе разнородны и часто несовместимы. Существуют и другие сложности, вызванные отсутствием единого стандарта.

Решение

Проект Денигма предназначен для заполнения создавшейся инструментальной ниши. Он представляет собой унифицированную базу знаний, в которой данные могут быть приведены к одному знаменателю. Денигма это сервис для исследований старения для представителей научного сообщества и других специалистов, экспертов и любителей из самых разных областей (инжиниринга, бизнеса, лоббирования и прикладной науки). Работа на Денигме будет облегчать формирование междисциплинарных исследовательских команд и получение обогащенных междисциплинарным подходом данных, она даст возможность фрагментировать проблему старения до небольших задач, которые могут быть отданы на краудсорсинг. Таким образом, исследования биологии старения ускорятся, а развитие сообществ, способствующих разработке геропротекторных технологий, получит новый импульс.

Цели проекта

  1. Создать содержательную базу знаний со всеми требуемыми онтологиями
  2. Опубликовать или способствовать публикации статей о проекте
  3. Выявить новые методы воздействия на процесс старения, и рекомендовать их для тестирования на простейших модельных организмах.

Задачи проекта

В ближайший год мы намерены:

  1. Разработать базу знаний для анализа данных с фокусировкой на вмешательствах, способных продлевать жизнь;
  2. Выявить и стандартизировать связанные блоки данных;
  3. Привлечь ученых и группы любителей к формированию открытых команд, получающих надежные научно обоснованные результаты.

Положительные эффекты от реализации проекта

- Упрощение и ускорение анализа данных. Обладая базой знаний и стандартизированными блоками данных, мы существенно сократим стадию подготовки данных. Один и тот же интерфейс будет использоваться для доступа к различным блокам данных.

- Обогащение анализа данных. База знаний и стандартизированные блоки данных позволят работать с множеством переменных одновременно в рамках разных дисциплин.

- Стимулирование разработки новых идей. Привлечение к работе людей с разными профессиональными навыками, имеющих различный опыт, совместная работа представителей научного сообщества и других общественных институтов приведет к генерированию большего числа новых идей.

- Ускорение эволюции теорий старения. В рамках нашего подхода к организации проекта только целостные и находящие научное подтверждение теории старения смогут получить развитие. Остальные будут опровергнуты и отброшены как неверные.

- Ускорение исследований биологии старения. Распределение задач между разными коллективами должно ускорить получение новых знаний и разработку новых эффективных геропротекторных средств.

Стоимость проекта.

Ежегодно проекту требуется 300 тысяч долларов. Из этой суммы планируется оплачивать труд четырех основных разработчиков, расходы на помещение, компенсации экспертам и затраты на продвижение проекта. Если вы желаете оказать проекту финансовую поддержку, или знаете кого-либо, кто мог бы быть в этом заинтересован, пожалуйста, свяжитесь с нами!

Руководители проекта

Дэниэл Вутке, член Совета основателей Международного альянса за продление жизни. Основатель проекта. К.б.н., специалист по молекулярной медицине, геномике, программированию и нетворкингу. Проводит исследования влияния диеты на процессы старения на базе Университета Ливерпуля, в Группе интегративной геномики старения. Внештатный специалист Института Биостатистики и Информатики в Медицине в Университете Росток (Германия).

Антон Кулага, член Совета основателей Международного альянса за продление жизни. Ведущий разработчик программной части проекта. Специалист в области семантиквеб технологий, разработки приложений, визуализации данных и нетвокинга.

E-mail: antonkulaga@gmail.com

Языки общения: английский, русский, украинский

Другие члены команды

Вадим Бартко: специалист в области обратного конструирования, обработки естественного языка, поиска данных.

Дмитрий Борисоглебский: к.т.н., специалист в области системного анализа, инженерии знаний, тимбилдинга, семантических сетей.

Научный совет проекта

Бен Горцель: искусственный интеллект

Дэвид Кекич: предпринимательство

Джон Адамс: бизнес, психология

Майк Дункан: биоинформатика, медицинские системы

Жоайо Педро де Магальхаес: генетика, биоинформатика

Джордж Фуллен: системная билогия

Обри ди Грей: регенеративная медицина

Джефф Халл: инжиниринг

Проект осуществляется в сотрудничестве с SENS Foundation.

Данный проект является междисциплинарным, затрагивает такие области как информационные технологии, биология, краудсорсинг, разработка приложений, биология, биоинформатика. Будем рады присоединению к команде специалистов этих и других профилей. Пишите ваши идеи и предложения на контактный электронный адрес руководителей проекта или заполните Анкету Единомышленника.